一、佩恩怎么死的
佩恩是被鸣人杀死的，具体情节如下：
人间道被鸣人一出场一拳打碎；畜生道被鸣人在蛤蟆的口里用螺旋丸打中而死；修罗道被鸣人的“仙法·螺旋手里剑”打死；地狱道中了鸣人的计，被鸣人一拳打死；饿鬼道在吸鸣人查克拉时被鸣人故意用仙术反噬变成了蛤蟆石像，再被鸣人打碎；天道最后在鸣人用了“仙法·螺旋手里剑”时用“神罗天征”互相抵消，在5秒之内，周围的岩石变回鸣人的分身（鸣人事先藏好的），捉住天道，鸣人最后一个螺旋丸杀死天道。
佩恩六道被漩涡鸣人逐个击败后，鸣人在小南用纸制作的一棵大树里找到了佩恩的本体——长门，两位预言之子终于相遇。鸣人想要知道长门的过去，并想从长门的经历找出和平的答案。长门将父母之死及挚友弥彦之死一生两大痛楚向鸣人讲述后，鸣人拿出了自来也的写的第一本书《毅力忍传》。
《毅力忍传》的写作灵感来源于自来也的一个弟子，这个弟子正是长门。一番谈话后，被鸣人的神奇力量感化，重拾年少时期的梦想，放弃和宇智波带土的原定计划，用外道·轮回天生之术复活了在木叶一战所死之人，将自己的意志托付给了鸣人，期待鸣人能够完成《鸣人物语》，力竭而亡。
拓展资料本体长门为操纵生与死的第七佩恩-外道（外道，Gedō，Outer Path），能使用佩恩六道的所有技能。由于支配佩恩的六道本体查克拉被黑棒隐藏，故本体的位置难以被逆追踪，由于长门在弥彦刚死时双脚被半藏预先藏在地底的符爆阵炸伤，因此必须在机械的辅助下才能够移动，而利用结印施展的忍术则不受影响。
参考资料：佩恩_百度百科
二、火影忍者中六道佩恩都是怎么死的,在第几集被干掉的
六个人都是鸣人打死的。
一开始卡卡西等人和天道和修罗道打，干掉修罗道，卡卡西阵亡。
后来木叶丸用螺旋丸打伤地狱道。
后来天道用神罗天征后，地狱道把修罗道复活。
六个佩恩齐聚鸣人面前
一上来，修罗道要攻击纲手，鸣人一拳把他打得粉碎。
再来是饿鬼道，鸣人用了一招“蛙对练”，隔空打牛，干掉饿鬼道。
再来，鸣人使出仙术·螺旋手里剑，干掉人间道，又把畜生道引到蛤蟆老大的嘴里，用了螺旋连丸干掉畜生道，此时地狱道把饿鬼道复活，鸣人孤注一掷，又使出仙术·螺旋手里剑，其实是个幌子，从空中又用螺旋连丸干掉地狱道。此时被复活的饿鬼道从身后抱住鸣人，吸收他的查克拉，鸣人将计就计，引出仙术查克拉，饿鬼道无法适应，被石化成青蛙。就剩最后一个天道。鸣人爆六尾，引天道出村子，天道用地爆天星，困住鸣人，鸣人再次爆八尾，后来经四代感化，变回原样。此时天道力量衰减，无法维持地爆天星，鸣人挣脱。最后用自来也传授的螺旋丸秒杀天道。后来外道长门复活众人，自己力尽而亡，小南离去。
动画里是地353集
三、在动漫火影忍者中,佩恩最后是怎么死的
佩恩六道，日本动漫作品《火影忍者》的人物。「晓」首领长门所操控的六具忍者尸体的总称，每个佩恩都能使用一个系统的能力，六道分为天道、人间道、修罗道、畜生道、饿鬼道和地狱道，以天道为核心。全体具有视野共享的能力，互相配合，能够快速应对来自死角的攻击。曾击杀三忍之一的自来也，是火影忍者里实力最强的人之一，后被鸣人逐一击败。
352佩恩六道前来参见 353自来也豪杰物语(畜生道男子被消灭)383爆发仙人模式 384危机消失的仙人模式 385九尾捕获成功 386告白 387地爆天星 394漩涡鸣人物语
人间道（原为一泷隐忍者）灵魂吞噬：读取他人的思想，并吸走其灵魂并加上记忆封锁。修罗道好似人造人，掌管佩因体术，体内武器：身体是机械的，可在体内大量携带武器。阿修罗形态：身体化为三头六臂，腰部有刀刃般的尾巴。畜生道（原为一风魔忍者，后被一女人代替),通灵召唤术：轮回眼性质独有空间忍术，召唤可大量不同类的畜生道通灵兽。还可以借助戒指把其他的晓组织成员通灵出来。
召唤的龙虾有忍术水遁泡沫乱波饿鬼道（原为一草隐忍者）吞食：吸收一切属性的查克拉攻击。封印术吸术封尽：抓住对方会将对方的查克拉强行吸收.地狱道判决：幻术，掐住对方喉咙后，召唤阎罗，阎罗会使说谎的人失去生命。轮回：修复术，阎罗可以储存其他被六道所杀的人的生命，用于修复其他被毁的佩恩。外道风遁.烈风掌：长门小时候自来也教他的忍术。通灵之术：外道魔像1：能使用幻龙九封禁的通灵物。外道魔像2：释放白龙，吸收中术者灵魂。外道·轮回天生之术：释放被杀者的灵魂.使灵魂回归原来的肉体。
六道佩恩几乎将木叶全毁，这时主角赶到。开启仙人模式，对打N个回合，使用新的丸子将5道全毁，只剩天道。结果没打过天道。之后暴尾，出现8条尾巴，在第9条出现的临近，4代在主角的意识中出现并帮他重新封印！从新情形的主角大展身手，打败天道！但实际上，六道佩恩不仅6道。还有他们的原型，集合所有道的能力于一身的外道!!主角找到他，与他交谈，将他感化了！最后外道，也就是长门，用了他的最后的查克拉，使用轮回天生，将杀死的木叶忍者悉数复活！最终也因为查克拉超限使用而离开了人世！